Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIRT1Q96EB6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms