Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.431e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TACC1-227ENST00000523834 589 ntTSL 46.01□□□□□ -1.451e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.451e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.471e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CNTRL-203ENST00000373845 3881 ntTSL 1 (best)5.83□□□□□ -1.481e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ELL2-208ENST00000635633 467 ntTSL 35.81□□□□□ -1.481e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TM9SF4-205ENST00000450829 550 ntTSL 45.74□□□□□ -1.491e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.491e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MRPS6-205ENST00000488492 909 ntTSL 55.72□□□□□ -1.491e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.51e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DEK-206ENST00000512145 791 ntTSL 55.64□□□□□ -1.511e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.511e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.511e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 DEK-208ENST00000515770 730 ntTSL 55.27□□□□□ -1.571e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.591e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.61e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5.02□□□□□ -1.611e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 AC011468.2-201ENST00000598982 535 ntTSL 45.02□□□□□ -1.611e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PLCB1-208ENST00000487210 4781 ntTSL 1 (best)4.88□□□□□ -1.631e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PUS10-206ENST00000602599 6366 ntTSL 1 (best)4.79□□□□□ -1.641e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TAF1A-204ENST00000391883 894 ntTSL 54.78□□□□□ -1.641e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MTM1-201ENST00000306167 2955 ntTSL 54.74□□□□□ -1.651e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.661e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.661e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.681e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 LINC00862-203ENST00000636153 1186 ntTSL 54.57□□□□□ -1.681e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.691e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.71e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.711e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.711e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SLC33A1-205ENST00000475842 1060 ntTSL 34.32□□□□□ -1.721e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.721e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PPIG-204ENST00000417938 527 ntTSL 54.26□□□□□ -1.731e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CPSF6-206ENST00000550987 560 ntTSL 44.07□□□□□ -1.761e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CEP95-202ENST00000553956 2669 ntTSL 1 (best)3.98□□□□□ -1.774e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MLH3-211ENST00000556453 635 ntTSL 53.88□□□□□ -1.791e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 G2E3-203ENST00000544007 1003 ntTSL 23.87□□□□□ -1.791e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SLC33A1-204ENST00000468581 764 ntTSL 33.85□□□□□ -1.791e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.81e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.811e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 URI1-208ENST00000574233 486 ntTSL 33.75□□□□□ -1.811e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 URI1-203ENST00000570564 514 ntTSL 43.71□□□□□ -1.821e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 QKI-216ENST00000545346 457 ntTSL 53.71□□□□□ -1.821e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-231ENST00000590694 165 ntTSL 53.69□□□□□ -1.823e-7■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 QKI-214ENST00000544436 495 ntTSL 33.51□□□□□ -1.851e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 KDM4C-208ENST00000480996 405 ntTSL 33.38□□□□□ -1.871e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 MLH3-209ENST00000555671 931 ntTSL 53.26□□□□□ -1.891e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 BTN3A3-205ENST00000474790 587 ntTSL 43.16□□□□□ -1.91e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PXK-214ENST00000495557 437 ntTSL 32.99□□□□□ -1.931e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.941e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ATAD2-207ENST00000534257 544 ntTSL 42.88□□□□□ -1.951e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 IL6ST-214ENST00000577363 282 ntTSL 52.66□□□□□ -1.981e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.031e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TMEM123-206ENST00000529492 549 ntTSL 22.37□□□□□ -2.031e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TMEM123-205ENST00000528969 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 42.33□□□□□ -2.041e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 UBXN4-206ENST00000470687 549 ntTSL 22.29□□□□□ -2.041e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 AHI1-213ENST00000529865 428 ntTSL 32.19□□□□□ -2.061e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 AHR-203ENST00000475440 388 ntTSL 32.18□□□□□ -2.061e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 BTN3A3-203ENST00000467524 562 ntTSL 42.12□□□□□ -2.071e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.071e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TMEM123-207ENST00000531103 568 ntTSL 42.09□□□□□ -2.071e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 KYAT3-204ENST00000446900 1937 ntTSL 52.05□□□□□ -2.081e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 CEP95-204ENST00000577476 556 ntTSL 31.9□□□□□ -2.114e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 PRELID2-205ENST00000510259 525 ntTSL 31.86□□□□□ -2.111e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 ELL2-204ENST00000508694 743 ntTSL 51.82□□□□□ -2.121e-9■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TMEM123-203ENST00000525577 550 ntTSL 40.96□□□□□ -2.261e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 G2E3-209ENST00000550944 565 ntTSL 20.84□□□□□ -2.271e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 TJP1-206ENST00000473741 270 ntTSL 20.73□□□□□ -2.291e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.21□□□□□ -2.61e-6■■■■■ 31.4
TBRG4Q969Z0 GPI-212ENST00000589985 1516 ntTSL 319.1■□□□□ 0.651e-11■■■■■ 31.3
TBRG4Q969Z0 IGF1R-212ENST00000560186 551 ntTSL 412.32□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 31.3
TBRG4Q969Z0 IGF1R-213ENST00000560277 526 ntTSL 48.6□□□□□ -1.033e-6■■■■■ 31.3
TBRG4Q969Z0 SORL1-210ENST00000532451 2165 ntTSL 1 (best)23.33■■□□□ 1.331e-7■■■■■ 31.3
TBRG4Q969Z0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.848e-7■■■■■ 31.2
TBRG4Q969Z0 RNPS1-212ENST00000564822 314 ntTSL 420.28■□□□□ 0.848e-7■■■■■ 31.2
TBRG4Q969Z0 RNPS1-226ENST00000570051 735 ntTSL 220.28■□□□□ 0.848e-7■■■■■ 31.2
TBRG4Q969Z0 RNPS1-204ENST00000561518 1092 ntTSL 517.31■□□□□ 0.368e-7■■■■■ 31.2
TBRG4Q969Z0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.358e-7■■■■■ 31.2
TBRG4Q969Z0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.318e-7■■■■■ 31.2
TBRG4Q969Z0 RNPS1-209ENST00000564311 870 ntTSL 515□□□□□ -0.018e-7■■■■■ 31.2
TBRG4Q969Z0 RNPS1-207ENST00000562690 582 ntTSL 214.57□□□□□ -0.088e-7■■■■■ 31.2
TBRG4Q969Z0 CABIN1-206ENST00000454754 1321 ntTSL 1 (best)19.45■□□□□ 0.77e-7■■■■■ 31.2
TBRG4Q969Z0 CABIN1-205ENST00000445422 1472 ntTSL 218.97■□□□□ 0.637e-7■■■■■ 31.2
TBRG4Q969Z0 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 219.64■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 31.2
TBRG4Q969Z0 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.814e-6■■■■■ 31.1
TBRG4Q969Z0 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.894e-6■■■■■ 31.1
TBRG4Q969Z0 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.154e-6■■■■■ 31.1
TBRG4Q969Z0 NT5DC2-213ENST00000489316 772 ntTSL 515.6■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 31.1
TBRG4Q969Z0 NT5DC2-214ENST00000490681 560 ntTSL 413.92□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 31.1
TBRG4Q969Z0 SHANK2-220ENST00000608988 1879 ntTSL 522.54■■□□□ 1.22e-6■■■■■ 31.1
TBRG4Q969Z0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.961e-8■■■■■ 31.1
TBRG4Q969Z0 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 31.1
TBRG4Q969Z0 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 31.1
TBRG4Q969Z0 POLG-213ENST00000631044 4668 ntTSL 513.69□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 31.1
TBRG4Q969Z0 POLG-215ENST00000635986 2351 ntTSL 513.4□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 31.1
TBRG4Q969Z0 POLG-217ENST00000636774 4151 ntTSL 512.65□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 31.1
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