Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UTP4Q969X6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms