Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR2Q969E8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms