Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP13Q92995 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP13Q92995 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
USP13Q92995 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP13Q92995 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms