Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA4DQ92854 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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