Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TAF4BQ92750 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TAF4BQ92750 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms