Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOPBP1Q92547 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOPBP1Q92547 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms