Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms