Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FAT3Q8TDW7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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