Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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ZNF398Q8TD17 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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ZNF398Q8TD17 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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ZNF398Q8TD17 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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ZNF398Q8TD17 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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ZNF398Q8TD17 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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ZNF398Q8TD17 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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ZNF398Q8TD17 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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ZNF398Q8TD17 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF398Q8TD17 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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