Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C17orf47Q8NEP4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms