Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms