Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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