Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms