Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALYREFQ86V81 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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