Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2Q1Q7Z7E8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms