Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APTXQ7Z2E3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms