Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRCQ7RTU9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms