Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM5Q71RC9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms