Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XIRP1Q702N8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
XIRP1Q702N8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms