Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAXIP1Q6ZW49 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAXIP1Q6ZW49 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms