Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00299Q6ZSB3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms