Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF7IPQ6VMQ6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF7IPQ6VMQ6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF7IPQ6VMQ6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms