Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CSAG1Q6PB30 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms