Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q6P435 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q6P435 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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