Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 TIA1-202ENST00000361692 543 ntTSL 50.8□□□□□ -2.282e-7■■■■■ 30.5
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PRPF8Q6P2Q9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.31e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.661e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 HACD3-210ENST00000568793 1824 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.731e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.351e-6■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF518A-206ENST00000534948 8270 ntTSL 1 (best)-0.11□□□□□ -2.431e-6■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 UBE3A-222ENST00000630907 889 ntTSL 521.56■■□□□ 1.044e-12■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 UBE3A-213ENST00000626793 733 ntTSL 519.89■□□□□ 0.774e-12■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.518e-13■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.31e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 DONSON-211ENST00000457359 2273 ntTSL 515.37■□□□□ 0.051e-8■■■■■ 30.4
PRPF8Q6P2Q9 ADCK5-205ENST00000529654 2027 ntTSL 1 (best)15.25■□□□□ 0.033e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.048e-13■■■■■ 30.4
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