Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms