Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS3Q68E01 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
INTS3Q68E01 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms