Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms