Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FREM1Q5H8C1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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