Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDLIM3Q53GG5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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