Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C4orf46Q504U0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms