Protein–RNA interactions for Protein: Q49A88

CCDC14, Coiled-coil domain-containing protein 14, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC14Q49A88 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC14Q49A88 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC14Q49A88 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms