Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms