Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UVSSAQ2YD98 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms