Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms