Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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COL24A1Q17RW2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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COL24A1Q17RW2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
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COL24A1Q17RW2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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COL24A1Q17RW2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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COL24A1Q17RW2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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COL24A1Q17RW2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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COL24A1Q17RW2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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COL24A1Q17RW2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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COL24A1Q17RW2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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COL24A1Q17RW2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COL24A1Q17RW2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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