Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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