Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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