Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TCEA2Q15560 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TCEA2Q15560 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TCEA2Q15560 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TCEA2Q15560 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TCEA2Q15560 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TCEA2Q15560 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TCEA2Q15560 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TCEA2Q15560 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TCEA2Q15560 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TCEA2Q15560 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TCEA2Q15560 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TCEA2Q15560 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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