Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SKIV2LQ15477 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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