Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TTF1Q15361 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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TTF1Q15361 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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TTF1Q15361 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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TTF1Q15361 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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TTF1Q15361 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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TTF1Q15361 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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TTF1Q15361 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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TTF1Q15361 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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TTF1Q15361 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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TTF1Q15361 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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TTF1Q15361 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTF1Q15361 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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