Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
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PTPRKQ15262 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
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PTPRKQ15262 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
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PTPRKQ15262 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
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PTPRKQ15262 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
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PTPRKQ15262 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
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PTPRKQ15262 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
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PTPRKQ15262 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
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PTPRKQ15262 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
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PTPRKQ15262 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
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PTPRKQ15262 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
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PTPRKQ15262 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
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