Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3GAP1Q15042 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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