Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms