Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VGLL4Q14135 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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