Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COL9A2Q14055 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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