Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EXOSC2Q13868 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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