Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FHL3Q13643 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FHL3Q13643 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FHL3Q13643 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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